Tecniche di sequenziamento di nuova generazione (NGS) e possibili applicazioni per la sicurezza alimentare.

La presente tesi si propone di esporre brevemente le principali tecnologie attualmente disponibili per il sequenziamento dei genomi e il loro utilizzo nella sicurezza alimentare, ponendo attenzione sulla tecnica del pirosequenziamento e sulla piattaforma Illumina usati nei casi di studio presi in esame. Il primo caso di studio mostra come il pirosequenziamento sia efficace per analizzare la biodiversità microbiologica e le dinamiche batteriche in campioni di un prodotto della cucina Koreana, il kimchi, durante la fermentazione. Nel secondo caso di studio, è stata utilizzata la piattaforma Illumina Illumina MiSeq per esaminare il microbiota dell'intestino cieco di un campione di galline dal collo nudo, cresciute simulando un allevamento in pascolo all'aperto, e valutando le differenze del microbiota dell'intestino cieco in galline alimentate senza prebiotici con galline alimentate con l'apporto di due tipi diversi di mangimi prebiotici commerciali.