Analisi array-CGH in una coorte di pazienti affetti da disturbo del neurosviluppo e/o difetti congeniti multipli

Background: Chromosomal deletions and duplications are frequently at the core of a motley group of congenital disorders including neurodevelopmental disorders, intellectual disability, developmental delay, autism spectrum disorders, congenital anomalies and other complicated syndromes. The development of molecular cytogenetic techniques based on Chromosomal Microarray Analysis, like array-CGH, allowed to analyse the whole genome in order to research the changes in the number of copies (“Copy Number Variations” o CNVs) with a better resolution than standard karyotype; in this way, new syndromes associated with CNVs can be identified. Objectives and methods: The retrospective study, conducted at the Laboratory of Medical Genetics of AOU Città della Salute e della Scienza di Torino, submits a reassessment of array-CGH analysis of 1376 patients affected by neurodevelopmental disorders and/or multiple congenital defects. Results: Changes in the number of copies (CNVs) have been identified in 522 patients (38%); in this group there were 160 patients with at least one variation considered pathogenetic (pCNV). The pCNVs have been analyzed according to type, size, inheritance, distribution along chromosomes and associations with known diseases. In addition, cases with pathogenetic or undetermined significance variants have been divided by clinical presentation at the time of testing: they showed that the 59% and the 39%, respectively, have been investigated for a suspicious or complex clinical picture. Conclusions: Prospective study’s results confirm a detection rate of pCNVs (11,6%) consistent with other studies and also confirm CMA’s role in clinical diagnostic process of patients with a phenotype referable to neurodevelopmental disorders or congenital abnormalities.

Background: Delezioni e duplicazioni cromosomiche sono frequentemente alla base di un gruppo eterogeneo di disordini congeniti che comprendono disturbi del neurosviluppo, disabilità intellettiva, ritardo dello sviluppo, disordini dello spettro autistico, malformazioni congenite e altri quadri sindromici complessi. Lo sviluppo di tecniche di citogenetica molecolare basate sulla Chromosomal Microarray Analysis, come l'array-CGH, ha permesso di analizzare l'intero genoma alla ricerca di variazioni del numero di copie (“Copy Number Variations” o CNVs) con una risoluzione superiore a quella del cariotipo standard, permettendo di identificare nuove sindromi associate a CNVs. Obiettivi e metodi: Lo studio retrospettivo, condotto presso il laboratorio di genetica medica dell’AOU Città della Salute e della Scienza di Torino, propone una rivalutazione delle analisi array-CGH di 1376 pazienti soggetti affetti da disturbi del neurosviluppo e/o anomalie congenite multiple. Risultati: Varianti nel numero di copie (CNVs) sono state identificate in 522 pazienti (38%); tra questi 160 (31%) possedeva almeno una variante considerata patogenetica (pCNV). Le pCNVs sono state analizzate per tipo, dimensione, ereditarietà, distribuzione lungo i cromosomi e associate a sindromi note. Inoltre, i casi con varianti patogenetiche o di significato incerto sono stati divisi per presentazione clinica al momento del test mostrando che il 59% e il 39% rispettivamente erano stati indagati per un quadro sospetto sindromico o complesso. Conclusioni: I risultati dello studio prospettivo confermano un tasso di rilevamento delle pCNVs (12,5%) in linea con altri studi e ribadisce il ruolo del CMA nel percorso clinico-diagnostico di pazienti con fenotipo riferibile a disturbi del neurosviluppo o con anomalie congenite.