Studio della diffusione di Aliarcobacter spp. in carni avicole Piemontesi e valutazione delle potenzialità patogene degli isolati ​

Aliarcobacter spp. è un genere batterico appartenente all'ordine Campylobacterales, famiglia Arcobacteraceae, e comprende specie classificate come patogene emergenti: A. cryaerophilus, A. butzleri, A. skirrowii e A. cibarius sono le principali. Nonostante i casi d'infezione da parte di Aliarcobacter spp. risultino sempre più numerosi, la patogenicità e l'incidenza di questo genere è ancora sottostimata. L'obiettivo della ricerca è stato quello di valutare la diffusione di Aliarcobacter spp. nel settore avicolo Piemontese. In seguito alla messa a punto del protocollo di isolamento, la presenza di Aliarcobacter spp. negli allevamenti avicoli Piemontesi è stata valutata analizzando l' intestino e la pelle del collo dei polli. Tra gennaio e maggio 2021 sono stati analizzati 49 lotti appartenenti alle principali filiere produttive territoriali ottenendo 286 isolati la cui identificazione è stata eseguita attraverso l’utilizzo del MALDI-TOF (spettrometro di massa a tempo di volo) e confermata attraverso una multiplex PCR (mPCR), amplificando la regione genica corrispondente al 23S. Dei 286 isolati, 282 sono stati identificati dal MALDI-TOF come A. butlzeri, 2 A. cryaerophylus ,1 A. cibarius e 1 A. skirrowi. La mPCR ha confermato il 93.6% degli isolati identificati come A. butlzeri mentre per gli altri isolati è stata sequenziata la regione corrispondente al 16S rRNA confermando l'identificazione per A. cryaerophilus e A. cibarius, mentre A. skirrowi è stato identificato come A. cryaerophilus. Il MALDI-TOF pertanto, si è confermato un ottimo strumento diagnostico per A. butzleri mentre per le altre specie è necessaria un’ulteriore conferma. Il genere Aliarcobacter è stato isolato nel 100% dei lotti campionati, dimostrando di essere ampiamente diffuso nelle carni avicole del territorio. Per i lotti campionati sono state registrate informazioni riguardanti l'alimentazione somministrata, l'uso di antibiotici, la razza, l'età, il peso e la filiera di appartenenza: nessuna correlazione lineare significativa è stata riscontrata tra la presenza del genere batterico e tali informazioni. La valutazione dell'eterogeneità genotipica è stata ottenuta amplificando i geni hecA, hecB e irgA: la loro maggior variabilità li rende ottimi candidati per la valutazione dell'eterogeneità degli isolati e del loro potenziale patogeno. Non è stata rilevata alcuna correlazione significativa tra la loro presenza e le variabili precedentemente citate. La presenza di Aliarcobacter spp. nell’ambiente di macellazione è stata valutata eseguendo tamponi ambientali sulle superfici del macello presente sul territorio, operazione eseguita dopo la pulizia giornaliera. Aliarcobacter spp è stato isolato in tutte le fasi del processo di macellazione ma non in tutte le aree campionate. Le specie isolate sono state identificate dal MALDI-TOF (e confermate dalla mPCR) come A. butzleri e A cryaerophilus. La presenza del genere batterico in analisi sulle superfici e gli ambienti di lavoro è un'ulteriore possibile fonte di contaminazione della carne. Per comprendere maggiormente il meccanismo di virulenza di Aliarcobacter spp. sono stati condotti dei lavori preliminari finalizzati alla messa a punto di un protocollo di trasformazione genica. Il presente studio evidenzia l'alta presenza di Aliarcobacter spp. nel settore avicolo piemontese, svelando la crescente necessità di monitorarne la diffusione.