Identificazione di specie tramite MALDI-TOF di batteri isolati da emocoltura: confronto tra coltura "giovane" e metodi tradizionali

Bloodstream infections (BSI) are characterized by the presence of microorganisms in the bloodstream whose complications, if not treated properly, can lead quickly to sepsis, an excessive inflammatory response of the body that damages tissues and organs with potentially fatal consequences. The gold standard of the microbiological diagnosis of bloodstream infections is the blood culture. Its traditional protocol includes an initial incubation until its positivization, the microscopic observation of the relative slide after Gram staining, culture isolation by 24-hour incubation, identification of the isolated microorganism, and subsequent preparation of the antibiogram to obtain a report. Since this diagnosis is one of the most important aspects of the patient’s outcome, its Turn Around Time (TAT) is extremely important. TAT is the time that elapses between the positivization of the sample and the signature of the report by the Doctor. In order to improve the protocol of microbiological diagnosis and provide the patient with the most appropriate antibiotic therapy, in recent years, traditional microbiology has been complemented by “fast” methods that are innovative techniques, rapid, and highly specific. Based on these considerations, in this study, we compared identification of species using MALDI-TOF on bacteria isolated from blood cultures using traditional methods and "young" cultures. The latter method involves an isolation of the micro-organisms with an incubation time of 4 to 8 hours, a subsequent identification, and finally the preparation of the antibiogram, thus leading to a reduction in the reporting times. In addition, the identification of "young" colonies was also evaluated using the identification/antibiogram panels by biochemical methods.

Le infezioni del torrente circolatorio (bloodstream infections, BSI) sono caratterizzate dalla presenza di microrganismi nel circolo sanguigno le cui complicanze, se non trattate adeguatamente, possono condurre velocemente alla sepsi, ovvero a un’eccessiva risposta infiammatoria dell’organismo che danneggia i tessuti e gli organi con conseguenze potenzialmente mortali. La diagnosi microbiologica di infezione del torrente circolatorio ha come gold standard l’emocoltura il cui protocollo tradizionale prevede un’iniziale incubazione fino alla sua positivizzazione, l’osservazione microscopica del relativo vetrino previa colorazione di Gram, l’isolamento in coltura grazie a incubazione di 24 ore, l’identificazione del microrganismo isolato e il successivo allestimento dell’antibiogramma al fine di ottenere un referto. Poiché questa diagnosi rappresenta uno degli aspetti più rilevanti per l’outcome del paziente, risulta estremamente importante il suo Turn Around Time (TAT) ovvero il tempo che intercorre tra la positivizzazione del campione e la firma del referto da parte del Medico. Al fine di migliorare il protocollo della diagnosi microbiologica e fornire di conseguenza al paziente la terapia antibiotica più appropriata, negli ultimi anni la microbiologia tradizionale è stata affiancata da metodiche “fast” ovvero tecniche innovative, rapide e altamente specifiche. Partendo da queste considerazioni, nel seguente studio sono state confrontate l’identificazione da emocoltura delle specie batteriche tramite il MALDI-TOF utilizzando i metodi tradizionali e la coltura “giovane”. Quest’ultimo metodo prevede un isolamento dei microrganismi con un tempo di incubazione da 4 a 8 ore, una successiva identificazione e infine l’allestimento dell’antibiogramma, comportando così una diminuzione dei tempi di refertazione. Inoltre, è stata anche valutata l’identificazione delle colonie “giovani” utilizzando i pannelli per identificazione ed antibiogramma per mezzo di metodi biochimici.