The genus Colletotrichum is recognized as one of the most significant fungal genera in phytopathology. Anthracnose is one of the diseases caused by Colletotrichum spp., characterized by dark necrotic lesions, often circular or irregular in shape and depressed, which can rapidly enlarge and coalesce. The genus Colletotrichum has undergone several taxonomic revisions in recent years and currently includes 344 species divided into 20 species complexes (SC). A polyphasic approach, along with molecular analysis through Multi-Locus Sequence Typing (MLST), is generally adopted for species identification within the genus. Although primarily pathogens of tropical and subtropical regions, species within this genus have been widely reported in temperate zones, infecting various hosts and causing significant economic losses. The island of Madeira, with its rich plant biodiversity, particularly ornamental species, and favorable climatic conditions, may represent an ideal habitat for the proliferation of these fungi. Moreover, the island serves as a significant trade hub for imports and exports, potentially acting as a point of spread for plant pathogens, including Colletotrichum spp. The aim of this work was to obtain isolates of the genus Colletotrichum from symptomatic plant material collected in Madeira, to study the presence and diversity of species belonging to this genus in the area. Isolation was carried out from 63 plant samples, primarily leaves, showing symptoms of anthracnose. A total of 160 isolates were obtained, for which a preliminary ITS analysis was conducted to identify the SC to which they belong. Most of the isolates were found to belong to the acutatum, boninense, and gloeosporioides species complexes. Further analyses were conducted on a selection of 20 isolates from the gloeosporioides complex, and a multilocus phylogenetic analysis was performed on three genomic loci (ITS, gapdh, and ApMat). Representative isolates of each identified species were used for pathogenicity tests on apples of the Gala cultivar. The results obtained in this study provide a preliminary overview of the diversity of Colletotrichum species in Madeira and the potential pathogenicity of isolates belonging to the C. gloeosporioides complex on a different plant host.
Il genere Colletotrichum è riconosciuto come uno dei generi fungini più rilevanti in fitopatologia. L'antracnosi è una delle malattie causate da Colletotrichum spp. ed è caratterizzata da necrosi scure, spesso di forma circolare o irregolare e depresse, che possono ingrandirsi rapidamente e confluire. Il genere Colletotrichum ha subito diverse revisioni tassonomiche negli ultimi anni e attualmente comprende 344 specie suddivise in 20 complessi di specie (SC). Per l’identificazione delle specie del genere Colletotrichum si adotta generalmente un approccio polifasico e l’analisi molecolare Multi-Locus Sequence Typing (MLST). Sebbene siano principalmente patogeni delle aree tropicali e subtropicali, le specie di questo genere sono state ampiamente segnalate in zone temperate, infettando vari ospiti e causando notevoli perdite economiche. L'isola di Madeira, con la sua ricca biodiversità vegetale, in particolare di specie ornamentali, e le condizioni climatiche favorevoli, può rappresentare un habitat ideale per la proliferazione di questi funghi. Inoltre, l'isola rappresenta un nodo commerciale significativo per importazioni ed esportazioni, costituendo quindi un potenziale punto di diffusione di patogeni delle piante, tra cui Colletotrichum spp. L'obiettivo di questo lavoro era di ottenere isolati del genere Colletotrichum da materiale vegetale sintomatico raccolto a Madeira, per studiare la presenza e la diversità delle specie appartenenti a questo genere nella suddetta area.. L'isolamento è stato effettuato da 63 campioni vegetali, principalmente foglie, che mostravano antracnosi. Sono stati ottenuti un totale di 160 isolati per i quali è stata condotta un’analisi preliminare ITS al fine di identificare lo SC di appartenenza. È stata riscontrata una maggioranza di isolati appartenenti ai complessi di specie acutatum, boninense e gloeosporioides. Ulteriori analisi sono state condotte su una selezione di 20 isolati appartenenti al complesso gloeosporioides e su questi è stata eseguita un'analisi filogenetica multilocus su tre loci genomici (ITS, gapdh e ApMat). Isolati rappresentativi di ciascuna delle specie identificate sono stati utilizzati per test di patogenicità su mele della cultivar Gala. I risultati ottenuti nel presente studio offriranno una panoramica preliminare sulla diversità delle specie di Colletotrichum a Madeira e sulla potenziale patogenicità di isolati appartenenti al complesso C. gloeosporioides su un diverso ospite vegetale.
Diversity and pathogenicity of Colletotrichum spp. associated with leaf anthracnose on different plant hosts in Madeira, Portugal
CONSOLE, FABIO
2023/2024
Abstract
Il genere Colletotrichum è riconosciuto come uno dei generi fungini più rilevanti in fitopatologia. L'antracnosi è una delle malattie causate da Colletotrichum spp. ed è caratterizzata da necrosi scure, spesso di forma circolare o irregolare e depresse, che possono ingrandirsi rapidamente e confluire. Il genere Colletotrichum ha subito diverse revisioni tassonomiche negli ultimi anni e attualmente comprende 344 specie suddivise in 20 complessi di specie (SC). Per l’identificazione delle specie del genere Colletotrichum si adotta generalmente un approccio polifasico e l’analisi molecolare Multi-Locus Sequence Typing (MLST). Sebbene siano principalmente patogeni delle aree tropicali e subtropicali, le specie di questo genere sono state ampiamente segnalate in zone temperate, infettando vari ospiti e causando notevoli perdite economiche. L'isola di Madeira, con la sua ricca biodiversità vegetale, in particolare di specie ornamentali, e le condizioni climatiche favorevoli, può rappresentare un habitat ideale per la proliferazione di questi funghi. Inoltre, l'isola rappresenta un nodo commerciale significativo per importazioni ed esportazioni, costituendo quindi un potenziale punto di diffusione di patogeni delle piante, tra cui Colletotrichum spp. L'obiettivo di questo lavoro era di ottenere isolati del genere Colletotrichum da materiale vegetale sintomatico raccolto a Madeira, per studiare la presenza e la diversità delle specie appartenenti a questo genere nella suddetta area.. L'isolamento è stato effettuato da 63 campioni vegetali, principalmente foglie, che mostravano antracnosi. Sono stati ottenuti un totale di 160 isolati per i quali è stata condotta un’analisi preliminare ITS al fine di identificare lo SC di appartenenza. È stata riscontrata una maggioranza di isolati appartenenti ai complessi di specie acutatum, boninense e gloeosporioides. Ulteriori analisi sono state condotte su una selezione di 20 isolati appartenenti al complesso gloeosporioides e su questi è stata eseguita un'analisi filogenetica multilocus su tre loci genomici (ITS, gapdh e ApMat). Isolati rappresentativi di ciascuna delle specie identificate sono stati utilizzati per test di patogenicità su mele della cultivar Gala. I risultati ottenuti nel presente studio offriranno una panoramica preliminare sulla diversità delle specie di Colletotrichum a Madeira e sulla potenziale patogenicità di isolati appartenenti al complesso C. gloeosporioides su un diverso ospite vegetale.| File | Dimensione | Formato | |
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https://hdl.handle.net/20.500.14240/5916