Myelodysplastic syndrome (MDS) is a heterogeneous group of hematologic neoplasms characterized by variable pathological chromosomal and molecular aberrations; MDS clinical manifestation and prognosis are highly variable. MDS is characterized by ineffective hematopoiesis in the bone marrow and peripheral cytopenia with a tendency to progression mainly into acute myeloid leukemia (AML). MDS is a clonal disorder of hematopoietic stem cells in bone morrow already phenotypically oriented to common myeloid progenitors, that progressively acquires genomic abnormalities and gene alterations in biological pathways. Acquisition of genomic abnormalities drives the transformation of a normal hematopoietic cell into a clonal dysplastic cell leading to abnormal cellular maturation and enhanced apoptosis. MDS is a disease of the elderly with a median age at diagnosis between 60-75 years. In this work are shown latest generation technologies to identify somatic mutation in myelodysplastic syndrome, useful to diagnose MDS and to allow more accurate prognosis stratification according to progression risk with the ultimate purpose of selecting best therapy and appropriate treatment. Next generation technologies are chromosomal microarray (CMA) (array CGH, array SNP e Array CGH/SNP), mutational assays ( Real Time, NGS targeted, WES, WGS).

Le sindromi mielodisplastiche (MDS) sono un gruppo di patologie neoplastiche ematologiche, eterogenee per manifestazioni cliniche, prognosi, alterazioni citogenetiche e molecolari, caratterizzate da emopoiesi inefficace, citopenia periferica, rischio variabile di evoluzione in leucemia acuta. Tali disordini originano da una cellula staminale del midollo osseo, appartenente al sottogruppo delle cellule staminali mieloidi, già orientata in senso eritro-mielo-megacariocitario, che progressivamente acquisisce danni genetici in numerosi pathways biologici, si moltiplica producendo cellule displastiche che non riescono a completare la loro maturazione o non riescono a sopravvivere a lungo. Sono patologie che interessano la popolazione adulta con una media d’età, alla diagnosi, compresa tra i 60-75 anni. Vengono riassunte ed analizzate le caratteristiche delle metodiche di ultima generazione che permettono lo studio dei marcatori molecolari individuabili nelle MDS che possono facilitarne la diagnosi e consentirne una più accurata stratificazione indicando la prognosi e la tendenza alla progressione al fine ultimo di migliorare le scelte terapeutiche e selezionare gli opportuni trattamenti. Le metodiche analizzate sono le tecniche di analisi con microarray cromosomici (CMA) (array CGH, array SNP e Array CGH/SNP), saggi mutazionali (Real Time, NGS targeted, WES, WGS).

Analisi mediante tecnologia di ultima generazione per lo studio delle mutazioni somatiche nelle sindromi mielodisplastiche

FADIR, IBTISSAM
2019/2020

Abstract

Le sindromi mielodisplastiche (MDS) sono un gruppo di patologie neoplastiche ematologiche, eterogenee per manifestazioni cliniche, prognosi, alterazioni citogenetiche e molecolari, caratterizzate da emopoiesi inefficace, citopenia periferica, rischio variabile di evoluzione in leucemia acuta. Tali disordini originano da una cellula staminale del midollo osseo, appartenente al sottogruppo delle cellule staminali mieloidi, già orientata in senso eritro-mielo-megacariocitario, che progressivamente acquisisce danni genetici in numerosi pathways biologici, si moltiplica producendo cellule displastiche che non riescono a completare la loro maturazione o non riescono a sopravvivere a lungo. Sono patologie che interessano la popolazione adulta con una media d’età, alla diagnosi, compresa tra i 60-75 anni. Vengono riassunte ed analizzate le caratteristiche delle metodiche di ultima generazione che permettono lo studio dei marcatori molecolari individuabili nelle MDS che possono facilitarne la diagnosi e consentirne una più accurata stratificazione indicando la prognosi e la tendenza alla progressione al fine ultimo di migliorare le scelte terapeutiche e selezionare gli opportuni trattamenti. Le metodiche analizzate sono le tecniche di analisi con microarray cromosomici (CMA) (array CGH, array SNP e Array CGH/SNP), saggi mutazionali (Real Time, NGS targeted, WES, WGS).
Next generation technologies to identify somatic mutations in myelodisplastic syndromes
Myelodysplastic syndrome (MDS) is a heterogeneous group of hematologic neoplasms characterized by variable pathological chromosomal and molecular aberrations; MDS clinical manifestation and prognosis are highly variable. MDS is characterized by ineffective hematopoiesis in the bone marrow and peripheral cytopenia with a tendency to progression mainly into acute myeloid leukemia (AML). MDS is a clonal disorder of hematopoietic stem cells in bone morrow already phenotypically oriented to common myeloid progenitors, that progressively acquires genomic abnormalities and gene alterations in biological pathways. Acquisition of genomic abnormalities drives the transformation of a normal hematopoietic cell into a clonal dysplastic cell leading to abnormal cellular maturation and enhanced apoptosis. MDS is a disease of the elderly with a median age at diagnosis between 60-75 years. In this work are shown latest generation technologies to identify somatic mutation in myelodysplastic syndrome, useful to diagnose MDS and to allow more accurate prognosis stratification according to progression risk with the ultimate purpose of selecting best therapy and appropriate treatment. Next generation technologies are chromosomal microarray (CMA) (array CGH, array SNP e Array CGH/SNP), mutational assays ( Real Time, NGS targeted, WES, WGS).
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