Caratterizzazione genetica di un nuovo Equus caballus Papillomavirus isolato da una cavalla purosangue inglese I papillomavirus (PV) sono piccoli virus a DNA senza envelope, in grado di infettare diverse classi di vertebrati. Ad oggi, si conoscono 14 specie in grado di infettare cavalli e asini: 9 Equus caballus PV (EcPV1–9), 2 Equus asinus PV (EaPV1–2), e 3 Bovine PV (BPV1–3) [1]. I PV causano diverse forme di infezione, come la papillomatosi cutanea, la papillomatosi genitale, e i carcinomi. Tutti i genomi dei PV codificano per almeno cinque geni, divisi in geni precoci (E, early) e tardivi (L, late) [2]; la proteina L1 è quella maggiormente conservata, per questo motivo viene utilizzata per il rilevamento e l’identificazione dei PV [2]. In questo lavoro, è riportato il genoma completo di un nuovo tipo di EcPV (EcPV10), isolato da un cytobrush vaginale di una cavalla purosangue inglese subfertile. Inoltre, ne è stata indagata la genoprevalenza in Italia e si è cercato di comprendere la sua relazione con gli altri papillomavirus. Durante approfondimenti eseguiti sullo stato di fertilità di una cavalla purosangue inglese, è stato identificato un nuovo EcPV, utilizzando Next Generation Sequencing. L’identificazione è stata confermata tramite genome walking PCR e sequenziamento Sanger. Successivamente, è stato sviluppato un saggio per Real-Time PCR specifico per il nuovo EcPV. Da gennaio 2021 a luglio 2022, per investigare la genoprevalenza di EcPV10 in Italia, sono stati campionati e testati 216 cytobrush genitali. Il genoma circolare è lungo 7607 bp e condivide in media il 67% di identità con EcPV9, EcPV2, EcPV1, e EcPV6; inoltre presenta tutti i geni degli altri EcPV. Per questo, è stato classificato come EcPV10. Le analisi filogenetiche indicano una stretta associazione con EcPV9 e EcPV2 (genere Dyoiota 1) [2,3]. Nella stessa popolazione di cavalli, rispetto a EcPV2 e EcPV9, EcPV10 ha una bassa incidenza (3,7%). In conclusione, in Italia la prevalenza di EcPV10 è attualmente limitata. Questo potrebbe essere correlato a fattori legati alle proteine virali e alla capacità del sistema immunitario dell’ospite di riconoscere ed eliminare il virus. Inoltre, non è stata riscontrata alcuna associazione tra l’infezione da EcPV10 e la razza, a differenza di EcPV2 e EcPV9 con i cavalli purosangue inglese. Siccome il purosangue inglese è sottoposto per legge a monta naturale, si ritiene che EcPV2 e EcPV9 siano trasmessi sessualmente, mentre si ipotizza un altro meccanismo di trasmissione per EcPV10. Saranno necessarie ulteriori ricerche per comprendere meglio le potenziali interazioni tra l’ospite e EcPV10. [1] Li, C.-X. et al. Identification of a Novel Equine Papillomavirus in Semen from a Thoroughbred Stallion with a Penile Lesion. Viruses 2019, 11, 713. [2] De Paolis et al. Equus caballus Papillomavirus Type-9 (EcPV9): First Detection in Asymptomatic Italian Horses. Viruses 2022, 14, 2050. [3] Cappelli, K. et al. Detection of Equus Caballus Papillomavirus Type-2 in Asymptomatic Italian Horses. Viruses 2022, 14, 1696.
Caratterizzazione genetica di un nuovo Equus caballus Papillomavirus isolato da una cavalla purosangue inglese
MORATTO, GIULIA
2022/2023
Abstract
Caratterizzazione genetica di un nuovo Equus caballus Papillomavirus isolato da una cavalla purosangue inglese I papillomavirus (PV) sono piccoli virus a DNA senza envelope, in grado di infettare diverse classi di vertebrati. Ad oggi, si conoscono 14 specie in grado di infettare cavalli e asini: 9 Equus caballus PV (EcPV1–9), 2 Equus asinus PV (EaPV1–2), e 3 Bovine PV (BPV1–3) [1]. I PV causano diverse forme di infezione, come la papillomatosi cutanea, la papillomatosi genitale, e i carcinomi. Tutti i genomi dei PV codificano per almeno cinque geni, divisi in geni precoci (E, early) e tardivi (L, late) [2]; la proteina L1 è quella maggiormente conservata, per questo motivo viene utilizzata per il rilevamento e l’identificazione dei PV [2]. In questo lavoro, è riportato il genoma completo di un nuovo tipo di EcPV (EcPV10), isolato da un cytobrush vaginale di una cavalla purosangue inglese subfertile. Inoltre, ne è stata indagata la genoprevalenza in Italia e si è cercato di comprendere la sua relazione con gli altri papillomavirus. Durante approfondimenti eseguiti sullo stato di fertilità di una cavalla purosangue inglese, è stato identificato un nuovo EcPV, utilizzando Next Generation Sequencing. L’identificazione è stata confermata tramite genome walking PCR e sequenziamento Sanger. Successivamente, è stato sviluppato un saggio per Real-Time PCR specifico per il nuovo EcPV. Da gennaio 2021 a luglio 2022, per investigare la genoprevalenza di EcPV10 in Italia, sono stati campionati e testati 216 cytobrush genitali. Il genoma circolare è lungo 7607 bp e condivide in media il 67% di identità con EcPV9, EcPV2, EcPV1, e EcPV6; inoltre presenta tutti i geni degli altri EcPV. Per questo, è stato classificato come EcPV10. Le analisi filogenetiche indicano una stretta associazione con EcPV9 e EcPV2 (genere Dyoiota 1) [2,3]. Nella stessa popolazione di cavalli, rispetto a EcPV2 e EcPV9, EcPV10 ha una bassa incidenza (3,7%). In conclusione, in Italia la prevalenza di EcPV10 è attualmente limitata. Questo potrebbe essere correlato a fattori legati alle proteine virali e alla capacità del sistema immunitario dell’ospite di riconoscere ed eliminare il virus. Inoltre, non è stata riscontrata alcuna associazione tra l’infezione da EcPV10 e la razza, a differenza di EcPV2 e EcPV9 con i cavalli purosangue inglese. Siccome il purosangue inglese è sottoposto per legge a monta naturale, si ritiene che EcPV2 e EcPV9 siano trasmessi sessualmente, mentre si ipotizza un altro meccanismo di trasmissione per EcPV10. Saranno necessarie ulteriori ricerche per comprendere meglio le potenziali interazioni tra l’ospite e EcPV10. [1] Li, C.-X. et al. Identification of a Novel Equine Papillomavirus in Semen from a Thoroughbred Stallion with a Penile Lesion. Viruses 2019, 11, 713. [2] De Paolis et al. Equus caballus Papillomavirus Type-9 (EcPV9): First Detection in Asymptomatic Italian Horses. Viruses 2022, 14, 2050. [3] Cappelli, K. et al. Detection of Equus Caballus Papillomavirus Type-2 in Asymptomatic Italian Horses. Viruses 2022, 14, 1696.File | Dimensione | Formato | |
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